近日，一項涉及54個國家1000個家庭的研究表明，全外顯子組測序?qū)ξ创_診疾病的診斷率比經(jīng)典遺傳診斷方法還高?？茖W(xué)家們呼吁將全外顯子組測序作為未確診疾病的一線診斷工具，以給患者帶來更好的醫(yī)療護理。相關(guān)結(jié)果以《Clinical exome sequencing: results from 2819 samples reflecting 1000 families》為題發(fā)表在Nature子刊（European Journal of Human Genetics）上。

測序技術(shù)揭開罕見病的面紗

全球大約有8%的人受罕見病的影響。到目前為止，已知的罕見病有7000多種，然而科學(xué)家們認為還存在很多未被確定的疾病表型。從本質(zhì)上講，80%的罕見病都是由單基因引起，給人體帶來終生的風險和沉重的健康負擔。由基因功能發(fā)生改變而引起的罕見病往往具有較為嚴重的表型，如果得到早期診斷，那么許多患者的生活質(zhì)量將有望改善，甚至還可以在治療中獲益。

隨著遺傳檢測技術(shù)的發(fā)展，許多未知的罕見病逐漸被揭曉。但仍有一大半的患者接受傳統(tǒng)的臨床評價以及靶向基因檢測后，仍未得到確切的診斷。這對患者及其家庭來說十分嚴重，因為他們無法得到正確的治療以及準確的妊娠咨詢和預(yù)測。如今越來越多的研究對下一代測序（NGS）感興趣，因為NGS可以快速提供詳細的遺傳信息，為識別孟德爾疾病基因的因果變異提供了有效的方法。

基于單基因測序的經(jīng)典遺傳診斷方法往往會導(dǎo)致陰性或不確定的結(jié)果。在常規(guī)的基因檢測中，臨床全外顯子組測序是一種很有前景的診斷工具。全外顯子組測序技術(shù)聚集于基因組中信息最豐富的區(qū)域，并且能同時檢測數(shù)以千計的基因，可替代基因panel檢測和位點特異性分析，用于遺傳性疾病分子基礎(chǔ)的調(diào)查研究和臨床診斷。

到目前為止，全外顯子組測序已被證明對罕見疾病有害變異的檢出率達25%—30%，但大多數(shù)研究都集中在高度同質(zhì)（地理或臨床上）的病人組。另外，以往研究運用了不同的分類標準和針對高度選擇性表型或報道頻率高的人群，并且未堅持按照ACMG的指南進行。

全外顯子組測序可作為疾病的一線診斷工具

在這項研究中，研究人員報道了來自54個國家1000個全外顯子組診斷病例的異質(zhì)性隊列研究，包含了疾病、種族和家庭結(jié)構(gòu)或遺傳模式的分析，共涉及2819個樣本。這些病例具有廣泛的疾病表型譜。所有的全外顯子組測序均根據(jù)標準要求來實施。

他們在1000個家庭中診斷出了307個家庭存在致病性或可能致病性的變異，整體的分子診斷率為30.7%，這大大高于標準遺傳檢測技術(shù)（如染色體微陣列、染色體核型分析以及單基因檢測等）的診斷率。

該研究還驗證了全外顯子組測序能否作為多種疾?。òㄎ粗倪z傳疾?。┑囊痪€診斷工具。研究人員驗證了PTPN23、KCTD3、SCN3A、PPOX、 FRMPD4和SCN1B的特異性遺傳缺陷的因果關(guān)系，并在同個患者中檢測不同基因的致病變異以達到雙重診斷的目的。

他們發(fā)現(xiàn)，對于具有血緣關(guān)系或者具有嚴重癥狀的患者，全外顯子組測序的診斷率更高。與具有單個癥狀相比，全外顯子組測序?qū)哂卸鄠€癥狀的患者的診斷率更高。驗證試驗結(jié)果表明，全外顯子組測序是一種有效的診斷工具，特別是對非特異性或異構(gòu)表型的疾病而言。

最后，研究人員建議將全外顯子組測序作為所有未確診疾病的一線診斷工具，從而為個人醫(yī)療護理提供便利。