基因組編輯:誰能手握第四代新“剪刀”
CRISPR并不完美,有脫靶、難以實現(xiàn)單堿基精確編輯之類的缺憾。大家期待更好的技術(shù),一批生物學(xué)家也在CRISPR的榜樣激勵下另辟蹊徑,暗中競賽。
基因組編輯或許是今年最火熱的科學(xué)概念,不僅因為NgAgo技術(shù)爭議受人矚目,也因為基因組編輯造福人類的潛能,超過任何一種現(xiàn)代生物技術(shù)。在這一領(lǐng)域前沿,中國科學(xué)家舉足輕重。日前舉行的中國科協(xié)114期新觀點新學(xué)說學(xué)術(shù)沙龍上,全國一流的基因組編輯研究者,討論了這一新技術(shù)興起將帶來的沖擊。
微生物的剪刀,被人類拿來“咔嚓咔嚓”
CRISPR一次成本也就兩美元,而且它上手簡單,找個聰明的高中生到實驗室學(xué)習(xí)幾個星期也可以學(xué)會,就像在電腦上編稿子一樣。
中國科協(xié)的學(xué)術(shù)沙龍上,所有專家熱衷的技術(shù)就是CRISPR。CRISPR本來是微生物為保護自己演化出來的本領(lǐng)。這一系統(tǒng)存在于細菌體內(nèi),科學(xué)家發(fā)現(xiàn)它可以尋找和清除病毒基因:細菌把病毒基因的一小段存儲到自身DNA里一個叫CRISPR的存儲空間;再次遇到病毒入侵,細菌根據(jù)存寫的片段識別,切斷病毒DNA。
盡管利用細菌免疫系統(tǒng)來編輯基因,并非始于CRISPR。但科學(xué)家掌握了對蛋白Cas9的操作技術(shù)后,發(fā)現(xiàn)復(fù)合物在RNA指導(dǎo)下定向?qū)ふ夷繕?biāo)DNA序列然后切除之的效率是最高的。而且對多種目標(biāo)細胞都有效。
在CRISPR之前,ZFN(鋅指核酸內(nèi)切酶)和TALEN(類轉(zhuǎn)錄激活因子效應(yīng)物核酸酶)是最為人稱道的兩種基因組編輯技術(shù),大家也用它們在擬南芥、斑馬魚和許多生物上做了實驗。但CRISPR一蹦出地平線,前兩者相形失色。
ZFN和TALEN實驗要花費成千上萬美元,但CRISPR一次成本也就兩美元。而且它上手簡單,找個聰明的高中生到實驗室學(xué)習(xí)幾個星期也可以學(xué)會,就像在電腦上編稿子一樣。CRISPR技術(shù)迅速蔓延,覆蓋生物學(xué)界。在各國實驗室里,喜得了CRISPR這把微生物賜予的好剪刀,科學(xué)家興奮地埋頭在實驗室里“咔嚓咔嚓”,裁剪他們心儀的生命密碼。
生物學(xué)家喊“萬歲”,但仍想超越CRISPR
CRISPR并不完美,有脫靶、難以實現(xiàn)單堿基精確編輯之類的缺憾。大家期待更好的技術(shù),“貪婪”地盯著任何可能成為“第四代”的好工具。
2012年來,科學(xué)家將CRISPR廣泛應(yīng)用于各種動植物,用來研發(fā)新動物品種充當(dāng)人類疾病研究模型,還用來直接修復(fù)基因治療人類遺傳病,四處開花。
CRISPR這么好用,難怪有學(xué)者喊出“CRISPR萬歲”,但也不是沒有人挑戰(zhàn)它。
20世紀(jì)70年代研究者用大腸桿菌和酵母中的酶去編輯基因,也叫基因打靶,是第一代基因組編輯技術(shù);隨后是比它更高效、更普適的第二代基因組編輯技術(shù);第三代基因組編輯技術(shù)CRISPR重組率高了許多,而且可做到無痕編輯。會不會有第四代呢?
CRISPR并不完美,有脫靶(目標(biāo)是修改某一段基因,結(jié)果同時修改了另一段)、難以實現(xiàn)單堿基精確編輯之類的缺憾。大家期待更好的技術(shù),“貪婪”地盯著任何可能成為“第四代”的好工具;一批生物學(xué)家也在CRISPR的榜樣激勵下另辟蹊徑,暗中競賽。其中NgAgo就曾被寄予厚望,盡管后來被許多人稱之為無法重復(fù)。仍有不少學(xué)者堅持聲稱超越CRISPR的技術(shù)是遲早的事。
比如今年9月15日,中國南京大學(xué)發(fā)表了一項成果,用結(jié)構(gòu)引導(dǎo)的內(nèi)切酶實現(xiàn)體內(nèi)外DNA任意序列的靶向和切割。這個新工具在科協(xié)學(xué)術(shù)沙龍上被行內(nèi)專家稱道,認(rèn)為有較大的優(yōu)化空間。
另一方面,較早的ZFN和TALEN也不能說被打敗,還有改進版技術(shù)推出,也陸續(xù)有成果發(fā)表。
讓CRISPR更抓人眼球的,是今年為爭奪CRISPR的專利權(quán),幾家實驗室大打官司,互相詆毀,誰能笑到最后尚未可知。但毫無疑問,基因組編輯技術(shù)鋪就了一條金光大道。如果一項同樣好用的新技術(shù)能打破壟斷,對生物學(xué)家和消費者都是好事。
希望之光,“不治之癥”有救了?
CRISPR技術(shù)能很有效地改造人類胚胎,當(dāng)然也引起了“用基因組編輯技術(shù)來量身訂作完美嬰兒”的倫理憂思??茖W(xué)家表示:為了病人的需要,這些實驗有必要進行,但是必須謹(jǐn)慎進行。
“基因組編輯對消費者的好處,典型例子就是:有些病原先治不好,現(xiàn)在可以治好了?!北本┐髮W(xué)研究員魏文勝在科協(xié)學(xué)術(shù)沙龍上說。
近一年來基因組編輯應(yīng)用于醫(yī)療的喜訊不斷:有醫(yī)生利用經(jīng)ZFNs基因組編輯技術(shù)改造的細胞株,成功治愈了一個小女孩的“不治之癥”——急性淋巴細胞性白血??;還有實驗室報告CRISPR可以治療利伯先天性黑朦病,一種遺傳性視力衰退疾??;也有團隊利用ZFNs技術(shù)定點改造免疫細胞的CCR5基因,企圖讓人免于感染艾滋病。
另外,2015年中國科學(xué)家用基因組編輯清除了細胞中的乙肝,為克服這一頑疾闖出了一條新路。
CRISPR技術(shù)能很有效地改造人類胚胎,當(dāng)然也引起了“用基因組編輯技術(shù)來量身訂作完美嬰兒”的倫理憂思。從現(xiàn)在技術(shù)進步的速度,醫(yī)生會具備這樣的能力。但醫(yī)學(xué)倫理未必會容忍他們做這樣的實驗。
不久前,瑞典生物學(xué)家弗雷德里克?蘭納團隊用CRISPR技術(shù)精準(zhǔn)改造了胚胎DNA做出了精準(zhǔn)改變,目標(biāo)是剛受精幾天、還處于發(fā)育早期的人類胚胎。蘭納使胚胎中的基因失去活性,以了解它們在早期發(fā)育中發(fā)揮什么樣的作用,希望理解不孕不育和流產(chǎn)的原因。這項實驗被批準(zhǔn)但仍引起反對。
2015年,中山大學(xué)副教授黃軍就編輯人類胚胎的β地中海貧血癥相關(guān)基因,引起世界關(guān)注。后來中國另一個團隊也嘗試編輯人類胚胎以抵御艾滋病毒感染。以上實驗使用的是缺陷胚胎:由于接受兩個精子包含了一組多余的染色體而不能正常發(fā)育。雖然實驗獲得批準(zhǔn),但事后仍有一個中美聯(lián)合討論會議為此舉辦,表現(xiàn)了科學(xué)界對實驗倫理的謹(jǐn)慎。而在科協(xié)的學(xué)術(shù)沙龍上,相關(guān)科學(xué)家表示:為了病人的需要,這些實驗有必要進行,但是必須謹(jǐn)慎進行。
剪掉“壞片段”,制造更怡人的農(nóng)作物
如果僅有一段DNA序列被剪掉,沒有外來DNA插入,這種突變與天然突變并無區(qū)別。美國農(nóng)業(yè)部已表示基因組編輯農(nóng)作物不是轉(zhuǎn)基因,不需要監(jiān)管,可進入商業(yè)化進程。
新的基因組編輯技術(shù),讓植物育種變得更簡單了。比起治療絕癥,更優(yōu)質(zhì)的農(nóng)產(chǎn)品可能會是基因組編輯帶給普通人的第一項福利。
如果僅有一段DNA序列被剪掉,沒有外來DNA插入,這種突變與天然突變并無區(qū)別,那就不是轉(zhuǎn)基因生物。這可能意味著種植基因組編輯的植物不用批準(zhǔn)。美國農(nóng)業(yè)部已表示基因組編輯農(nóng)作物不是轉(zhuǎn)基因,不需要監(jiān)管,可進入商業(yè)化進程。如2016年,美國種植了基因組編輯的蘑菇。使用CRISPR技術(shù)剪掉了讓香菇變褐色的DNA。新式香菇?jīng)]有導(dǎo)入外來基因,而是剔除掉“壞片段”,因此不算轉(zhuǎn)基因食品,規(guī)避了相關(guān)的麻煩。
不僅是地里長的東西可以被編輯基因。美國一支團隊用CRISPR改造的酵母菌,得到了牛奶中的酪蛋白,從而生產(chǎn)出非動物來源的奶酪。改造的酵母菌還有希望用來改善啤酒的口味。
在科協(xié)學(xué)術(shù)沙龍上,中國農(nóng)業(yè)大學(xué)副教授陳其軍列舉了一系列美國農(nóng)業(yè)部批準(zhǔn)不受監(jiān)管的基因組編輯加以改良的作物:小麥、水稻、糯玉米、蔬菜、蘑菇、卷心菜……這份名單會越拉越長。而經(jīng)過基因組編輯的馬鈴薯、玉米等很快會在美國上市。陳其軍認(rèn)為,基因組編輯農(nóng)作物是否能推廣,要看各國監(jiān)管的寬松程度。
“新的基因組編輯技術(shù)可以提供一個非常自由的平臺。生物學(xué)家的空間非常大?!敝锌圃簞游锼芯繂T王皓毅在科協(xié)沙龍上說,“相比于美國頂尖實驗室,我們的執(zhí)行力弱可能是一個困難。”
大北農(nóng)公司的專家楊進孝也在會上表示,中國實驗室執(zhí)行力比較弱的原因,是實驗人員多為學(xué)生,面臨畢業(yè)問題。他認(rèn)為,企業(yè)應(yīng)該通過服務(wù)的方式參與進來,這有利于中國科學(xué)家專心做技術(shù)。
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